Το Αυτοτελές Τμήμα Ελέγχου Άρσης του Απορρήτου προβαίνει στην κατάσχεση μέσων παραβίασης του απορρήτου που υποπίπτουν στην αντίληψη της Α.Δ.Α.Ε. κατά την ενάσκηση του έργου της και ορίζεται μεσεγγυούχος αυτών μέχρι να αποφανθούν τα αρμόδια δικαστήρια.
Το Τμήμα έχει τις εξής αρμοδιότητες:
- Προβαίνει στην καταστροφή πληροφοριών ή στοιχείων ή δεδομένων τα οποία αποκτήθηκαν με παράνομη παραβίαση του απορρήτου των επικοινωνιών.
- Εξετάζει καταγγελίες σχετικά με την προστασία των δικαιωμάτων των αιτούντων, όταν θίγονται από τον τρόπο και τη διαδικασία άρσης του απορρήτου.
- Εξετάζει τη νομιμότητα εντολών άρσεως του απορρήτου, ήτοι καταγράφει και αρχειοθετεί τις εισαγγελικές διατάξεις και τα βουλεύματα των δικαστικών συμβουλίων περί άρσης του απορρήτου των επικοινωνιών και επεξεργάζεται αυτά, σύμφωνα με τους όρους και τις προϋποθέσεις της κείμενης νομοθεσίας.
- Παρέχει στοιχεία, στατιστικά δεδομένα, αναλύσεις και σχετικές με τις αρμοδιότητες του Τμήματος πληροφορίες στις υπηρεσίες και στην Ολομέλεια της Α.Δ.Α.Ε.
- Συνεργάζεται με άλλους φορείς και Ανεξάρτητες Αρχές στην Ελλάδα και στο εξωτερικό, στο πλαίσιο των αρμοδιοτήτων του.